Защита сельскохозяйственных животных от оружия массового поражения состоит прежде всего в их укрытии в заранее герметизированных скотных дворах, конюшнях, свинарниках, овчарнях и других помещениях. В помещениях создают запасы кормов и воды. Герметизации помещений для животных достигают тщательным проконопачиванием паклей, мхом, тряпками и заделкой щелей, обмазкой потолков и засыпкой их слоем песка или шлака, заделкой подпольных отверстий, уплотнением дверей, установкой в вентиляционных и печных трубах простейших фильтров из подручных средств (гравий, войлок, вата, трехслойная мешковина, наполненная сеном, мхом или опилками) или плотно закрывающихся задвижек.

Чтобы повысить защитную способность стен от радиоактивного излучения, их снаружи засыпают слоем земли высотой до 1 м и толщиной 40—50 см. Часть окон наглухо заделывают кирпичом, остальные окна закрывают деревянными, камышовыми (соломенными) матами. Двери в тамбуре герметизируют, завешивают брезентом или другим плотным материалом. Запасы грубых и концентрированных кормов, а также воды создают внутри или близ помещений. Для обслуживающего персонала оборудуют специальные комнаты на скотных дворах, конюшнях и т. п., а также строят укрытия возле животноводческих помещений.

Для защиты высокоценных животных заранее готовят торбы-противогазы и защитные накидки, которые должны находиться у станка каждого животного. Для таких животных в отдельных случаях оборудуют специальные укрытия. Устойчивость животных к инфекционным болезням повышают путем четкого выполнения мер зоогигиенического характера, кормления и своевременного проведения прививок согласно действующим инструкциям, а также путем систематического проведения дезинфекции, дезинсекции и дератизации на животноводческих фермах. Предохраняют водоисточники и фураж от заражения возбудителями инфекционных болезней, устанавливают охрану животноводческих ферм, пастбищ и мест водопоя, усиливают контроль на автомобильных, железных и шоссейных дорогах. Ветеринарный персонал тщательно следит за мясными и молочными продуктами, поступающими на рынок из колхозов и совхозов.